История кафедры начинается с 2004 года с момента образования общеобразовательной кафедры «Информатика».
Решением Ученого Совета от 29 августа 2013 года кафедра была реорганизована и переименована в кафедру «Информационные системы и вычислительная техника». С 2013 по 2017 учебный год заведующей кафедрой была кандидат технических наук. Курмангазиева Л.Т. Основная миссия кафедры была подготовка специалистов по направлениям информационные системы и вычислительная техника в инженерной деятельности. На кафедре подготовка студентов проходила по следующим специальностям: 5В070300-Информационные системы, специализация – Информационные системы и инженерной деятельности 5В070400-Вычислительная техника и программное обеспечение, специализация – Вычислительная техника и программные комплексы
23.06.2017г. кафедра была переименована в кафедру «Программная инженерия». Заведующей кафедрой стала кандидат технических наук Габбасова Ж.Д. Была включена специальности бакалавриата 5В060200-Информатика, магистратура 6М060200-Информатика.
С сентября 2020 года по 2022 года должность заведующей кафедрой «Программная инженерия» занимала кандидат технических наук Л.Т. Курмангазиева. С февраля месяца текущего года заведующей кафедрой является магистр, старший преподаватель Байтемирова Н.Б.
С 2019-2020 учебного года вводится прием на образовательные программы 6B001101 - Прикладная информатика в дизайне, 6B001102 - Бизнес-аналитика и управление ИТ-проектами, 6B001103 - Системное и сетевое администрирование, 7M06101 - Бизнес-информатика (2 года). ), 7M06111 - Бизнес-информатика (1г), 7M06102 - IT-менеджмент (1г), 7M06103 - Кибербезопасность (2г), 7M06113 - Кибербезопасность (1г), 7M01104 - Прикладная информатика в дизайне (2г).
Наши студенты и магистранты участвуют в научных исследованиях. Ежегодно проводятся конкурсы лучших работ на республиканских и международных конкурсах. Результаты исследований публикуются в материалах национальных и международных конференций. Лучшие студенты участвуют в международных олимпиадах по программированию (IT planet, 1С-программирование, web- технологии и др.) В тоже время наши студенты принимают активное участие в социальной и спортивной жизни университета. В частности, дипломом 3-й степени награжден студент специальности 5В070400 – «Вычислительная техника и программное обеспечение» Ашигалиев К., в 2019 году – награжден дипломом 3-й степени студент 4 курса специальности 5В070400 – «Вычислительная техника и программное обеспечение» Орынбай Алишер. Научный руководитель: магистр Н.Б.Байтемирова.
Звание «Лучший преподаватель вуза» присвоено кандидату технических наук, доценту Махатовой В.Е. (2020), к.ф.-м.н., доцент Ележанова Ш.К. (2021), к.т.н., доцент Курмангазиева Л.Т., магистр, старший преподаватель Байтемирова Н.Б. (2021).